(3)函证内容不同
银行询证函不仅询证被审计单位在银行的存款，还要函证借款。询证费用可直接从被审计单位存款账户中收取;
企业询证函不仅询证被审计单位应收账款，还要询证预收账款，且在询证函中要说明函证仅为复核账目之用，并非催款结算。
应付账款函证内容就是应付的金额。
(4)函证的时间不同
应收账款和银行存款一般在期末或之后函证;而对应付账款，在资产负债表日函证更有效。
